随着养鸡业规模化发展，一些新的疾病不断出现，防控疫病的压力越来越大，给养鸡业带来很大的威胁。为了控制饲养环境中病原微生物的传播和繁衍，切断疾病传播途径，养殖场必须实施科学的消毒方案，为鸡的健壮生长提供安全的生活环境。
在养鸡卫生防疫方面，采取有效的消毒管理，才能杀灭或消除饲养环境或器具、设备表面的有害微生物，减少微生物的数量，从而防止传染病的发生和传播。进雏之前，对鸡舍进行彻底清洗和熏蒸消毒，避免上一批次的病原微生物传染给下个批次。饲养管理过程中，应每周带鸡消毒两次，每周进行一次场内环境消毒，以免病原微生物在栋舍间进行传播。提倡全进全出的横向隔离防疫手段，消毒这一方式也能在横向传播和纵向传播方面起到积极作用。尤其不同日龄栋舍间的消毒隔离，体现尤为明显。鸡感染呼吸道疾病的主要传播途径靠灰尘和飞沫，鸡舍外界环境卫生也是引起家禽呼吸道疾病的重要因素之一。通过带鸡消毒，消毒药水的小液滴可以黏附空气中的粉尘及病毒细菌颗粒，起到降尘杀毒的作用。通过坚持带鸡消毒，一般情况下鸡舍内鸡只发生呼吸道疾病的概率及投药费用会有明显降低；鸡只体质健康也得到保障使得其能更好地发挥生产性能。同时还要做好饲养密度管理，加强饲养环境管理，从而能够有效预防家禽的呼吸道疾病。在进行鸡舍内的消毒时，消毒液中的水分不仅能够沉降灰尘和飞沫，还可以提高空气的湿度，有利于呼吸道黏膜的健康发育。舍内水汽通过蒸发散热，能够起到降低舍内温度的作用。夏季舍内温度较高时，通过喷雾可以降低舍温 2-3℃，能够有效地起到防暑降温的作用，减缓热应激对鸡带来的影响。在寒冷的冬季进行喷雾消毒前，为了避免舍内温度下降较多对鸡产生冷应激，建议将鸡舍温度提高 2℃左右，有利于减轻消毒降温的影响。 确保消毒效果的前提是进行认真清扫工。部分养殖者忽视清扫工作的重要性，往往在没有清扫的情况下进行消毒，消毒效果无法保证。建议空舍期间的消毒程序为：清扫、冲洗、喷洒消毒、熏蒸消毒。带鸡消毒前应将舍内卫生打扫干净，场区环境消毒前也应进行认真清扫，有条件的可以用清水冲洗干净后，再进行喷洒消毒，这样才能彻底杀灭环境中存活的病原微生物，获取有效的消毒效果。部分养鸡场没有制定科学的消毒程序，只是采取随意性消毒。在喷洒消毒鸡舍时杂乱无章，不能按照由里到外、从上到下的顺序。不重视带鸡消毒，只进行场区和门口消毒，在对鸡舍消毒时只简单喷洒一遍，而对屋顶、排粪沟、设备和用具等没有彻底消毒，这样病原微生物就有了良好的繁殖场所，为鸡感染疾病奠定了基础。养殖场必须制定科学的消毒程序，根据空舍消毒、带鸡消毒、环境消毒、用具和设备消毒等的不同，制定相应的消毒程序，定时、定量、定人做好消毒工作，并在消毒结束后安排兽医人员进行检测，只有检查病菌含量合格后才能说明消毒工作是有效的。
